Matematika, fizika, kemija

Stigla nova metoda za produkciju sintetskog DNK

L.B.

Stvorene sekvence DNK nazivaju se i oligonukleotidi. Oni imaju široku primjenu kod identifikacije bolesti, u proizvodnji lijekova na bazi oligonukleotida i drugih medicinskih i biotehnoloških primjena.

Velika potražnja za oligonukleotidima zahtijeva učinkovitu automatiziranu metodu njihove kemijske proizvodnje. Ovaj se postupak oslanja na fosforamidite, kemijske spojeve čiji je jedini nedostatak to što su nestabilni ako se ne čuvaju na temperaturi od idealnih -20 Celzijevih stupnjeva.

Instrumenti koji se koriste za sintezu DNK ne mogu adekvatno ohladiti fosforamidite, zbog čega se neki od njih razgrađuju nakon što su dodani u određeni instrument.

Stoga je tim znanstvenika krenuo u potragu za relativno jednostavnom, ali učinkovitom, metodom koja bi mogla automatizirati proizvodnju fosforamidita i integrirati je izravno u instrument za sintezu DNK. Time se izbjegava ručna sinteza, koja bi obično trajala do 12 sati, kao i problem skladištenja nestabilnih fosforamidita.

U ovoj metodi proizvodnje fosforamidita, nukleozidi (polazni materijali) ispiru se kroz čvrsti materijal (smolu), koji se potencijalno može u potpunosti integrirati u automatizirani postupak u instrumentu za sintezu DNK. Smola osigurava brzu fosforilaciju nukleozida, pri čemu se nukleozidi pretvaraju u fosforamidite u roku od nekoliko minuta. Iz smole se fosforamiditi automatski ispiru na dio instrumenta koji je odgovoran za sintezu DNK.

Time se izbjegava razgradnja fosforamidita, koji se ovdje prvi put stvaraju neposredno prije nego što će se upotrijebiti, na brži i učinkovitiji način. Odlično je i to što je ova metoda zasnovana na protokolu kojim automatizirano mogu upravljati i nekemičari, tako da bi ona mogu ugledati i svoju mnogo širu primjenu.

Izvor: Interdisciplinary Nanoscience Center

Možda će vas zanimati